A defesa da autonomia universitária é uma luta encampada pela ADUA desde sua criação enquanto entidade e se confunde com os enfrentamentos do movimento docente contra a Ditadura Civil-Militar.

Ao longo dos 40 anos, da Seção Sindical sempre foi umas das suas bandeiras principais na tentativa de construir uma universidade referenciada nos interesses da maioria da população e não nos interesses empresariais.

Mantendo esse aspecto, o Sindicato lançou, em 2019, a campanha Autonomia Universitária, que tinha o propósito de formar e informar a comunidade academica e a sociedade de forma geral sobre a importância da autonomia universitária, constitucionalmente garantida!